茵蒂克絲所屬的「英國清教」大本營‧倫敦。這個魔法之都，卻因以騎士團長為首的「騎士派」發動叛變而遭到攻陷。影響所及遍佈全英國，陷入了連市街中一般市民也被軍方拘禁的異常事態。在「騎士派」進行的「變革」漩渦中，擁有魔法師的「清教派」在各地的抵抗戰依然持續著。為了搭救茵蒂克絲，而前往福克斯通的上条當麻，終於來到叛變的主謀面前。在那裡的是「神之右席」成員後方之水。而且他兵戎相向的對象，是英國王室第二皇女凱莉莎&hellip&hellip！

追蹤牛仔褲之狼的神裂、與奇怪的賣草少女相遇的上条刀夜、強度微妙的等級5超能力者第七號、在決心殺人的少女面前出現，自稱「御坂」的男性、被打混的美容師搞到火大的白井、向初春挑戰的駭客少年、受到修長美女仰慕的砂皿緻密、熱愛血型占卜的御坂妹妹們、在某方面覺醒的雪莉、與絹旗一起看電影約會（？）的濱面…補完本篇的外傳SS系列第二彈！

由於亞維農的侵攻作戰，造成學園都市沒有了治安部隊。成為無法治地帶的此地，黑暗組織在暗中活躍。其中，有為了自己行動的人。愛好黑暗，以嗜殺為樂的人。意圖打碎他人希望的人。為了重要的人而戰的人。向上層挑戰的人。想除掉叛亂份子的人。試圖以暴力阻止失控的人。在科學支配一切的這城市裡，能存活下來的是……當「集團」的等級5超能力者一方通行，與謎樣的組織「學校」相遇，故事就此展開──！

《魔法的禁书目录1》内容简介：纯白的修女从天而降，来到自己的房间。“这怎么可能啊……”上条当麻低语着。但那名修女打扮的少女却表示，她是从魔法的世界逃到这里来的。这里是将“超能力”认知为“一般科学”的反超自然学园都市。 上条对这名自称“禁书目录”的神秘少女的言行起了很大疑心，然而真正的“魔法师”却在两人眼前出现了——！ 由众所期待的新锐作家镰池和马所推出的学园动作小说，于日本出版广受好评后，简体中文版终于正式登场！

羅馬正教「神之右席」中的一人「前方之風」侵入了學園都市。 她所操縱的謎樣魔法造成都市機能完全癱瘓， 大部分的人都遭奪去意識而倒下。 她的目標，正是上条當麻這個羅馬正教正式認定的敵人。 同一時刻。最強的超能力者一方通行，為了守護支持他的少女「最後之作」， 與科學家木原數多率領的武裝集團「獵犬部隊」發生激烈衝突。 魔法與科學，兩件慘事同時發生在學園都市……