“有个女孩被抓了。” 这里是将“超能力”认知为“一般科学”的发超自然学园都市，在“三泽塾”里有一名巫女遭到囚禁。主谋者看来是会使用魔法的人物。上条当麻在听了魔法师史提尔的说明后，却很干脆地点头应允。 “我倒希望你别答应得那么干脆，因为我就是来带你一起去的。” “……啊?!” 于是两人走向了一座在夏日艳阳中矗立的诡异大楼。 魔法师、吸血鬼杀手、禁书目录以及上条当麻。当所有支线交会之际，故事就此展开！

10月30日。第三次世界大戰開戰後，已經過了十一天。三名少年各懷心思，衝進戰火瀰漫的俄羅斯。 前「道具」的小嘍囉濱面仕上，為了治療瀧壺理后四處奔走， 可惜卻苦無線索。解決的關鍵在於他遇見的前「神之右席」聖人後方之水。 最強的等級５超能力者一方通行，在經過與最弱的強敵鏖戰後， 被移送到伊利沙里納獨立國同盟。他依然遍尋不著解救最後之作的方法。 解決的關鍵在於上頭記載著魔法的神祕羊皮紙。 而上條當麻終於遇見了右方之火，卻也是因為對方手下留情， 才有機會逃走獲救。然而他至今還無法讓茵蒂克絲恢復原狀。 解決的關鍵在於人稱「天使」的異次元居民。 他們三人懷著三種想法，當科學與魔法交會時，故事就此開始──！ 本書特色 本書為作者鎌池和馬的出道作品， 目前已出版24冊。 已有外傳漫畫作品《科學超電磁砲》連載中， 並推出本傳的漫畫版連載 以及廣播劇。已拍成TV版動畫在日本播映，第二季也已推出。

羅馬正教的黑暗部「神之右席」的後方之水終於行動了。這個兼具「聖人」力量與「神之右席」的「特性」，最強大、難纏的敵人，為了上条當麻的「右手」而侵入學園都市。接到後方之水事前宣告的英國清教，派出天草式十字淒教的五和擔任上条的保鑣。住進上条家以便護衛的五和，憑著精湛的料理技術與貼心的照顧，甚至威脅到老是白吃白喝白住的修女茵蒂克絲。看到天差地別的兩人，讓上条不禁流下兩行清淚…然而和平的時光並不長久，最強最大的敵人終於出現！

由上条當麻與吹寄制理的日常生活話題為開端，變成了全班的火鍋派對，可是卻讓小萌老師大為困擾!?在倫敦，由魔法師少女們所交織的混亂（？）一天是怎麼回事？墜入學園都市黑暗面的一方通行。等待著他的是什麼？跟放電國中妹長得一模一樣的容貌。她來到學園都市的理由是？補完《魔法禁書目錄》本篇的SS系列登場，收錄4個短篇故事。

十月。世界各地突然發生羅馬正教徒的反科學示威遊行。這樣的反抗行動，無疑是對以學園都市為首的「科學勢力」的反彈。在世界一片混亂中，上条得知此事件的元凶是名為「C文書」的靈裝，他跟土御門元春一起前往「C文書」所在的法國觀光都市亞維農。在亞維農當地，上条跟天草式十字淒教的成員五和重逢，與她一起搜索「C文書」……但「神之右席」的左方之地，突然出現在他們面前。當科學與魔法交會時，上条當麻的故事就此開始！

学园都市中最盛大的活动“大霸星祭”。 这是位于超能力开发机构——学园都市的所有学校所共同举办的超大规模运动会。 上条当麻当然也参与了这项活动，但是他的“不幸”依然健在，不仅被肚子饿的茵蒂克丝咬，遭到大霸星祭营运委员吹寄制理谴责，还在比赛中被御坂美琴放电攻击…… 就在这时，某个魔法师为了神秘灵装“刺突杭剑”，潜入了学园都市。 欧莉安娜·汤姆森，在魔法业界中首屈一指的“送货人”，人称“追踪封锁”的她，到底有何目的…… 当科学与魔法交会之际，上条当麻的故事即将开始——！