永井圭突然變成不死身的新人類「亞人」。由於捕獲他便有獎金，他正在逃離所有企圖捕捉他的人類。在逃跑過程中，圭即將發現遭到隱瞞的亞人真相── 官方說法表示亞人無害，但其實亞人之中存在著「異種」。異種擁有特殊能力，可以召喚出危險性極高的「黑色幽靈」。 與幫助自己逃跑的唯一一名同伴‧海訣別後，圭嘗試與其他亞人接觸……

既存の人類との共生か、それとも敵対か――。亜人となった永井圭が最初に接触を試みた同朋、「帽子」こと佐藤の正体は凶暴なテロリストであった。自分に凄惨な人体実験を行った当局の研究員の命をめぐって、永井圭は皮肉にも佐藤との全面対決に踏みきる。

「喰種」の内臓を移植され、徐々に怪人へと近づいてゆくカネキ。葛藤の中、「あんていく」で働くことを決意したカネキの前に、“白鳩"と呼ばれる「喰種捜査官」が現れる。天敵は貪欲に、狡猾に、「喰種」を追っていた──!

天敵“白鳩"に両親を殺害された少女・ヒナミ。悲劇の少女の為に、“白鳩"の本拠地[CCG]へカネキとトーカは足を踏み入れる。そこには、受け入れざるを得ない悲しみの螺旋階段が待ち受けていた──!

由乃を倒すため、過去へと跳躍する雪輝と９ｔｈ。そこで、ふたりが見たものとは…。雪輝は彼の望む未来を手に入れることができるのか！？驚愕と感動の最終巻！！