地球が壊滅的被害を受ける巨大隕石の落下。それを察知した政府が人類の種を存続させるために決行した計画「７SEEDS」。離ればなれになってしまった彼らは、再会を果たすため、それぞれが動き始めた。行き着いた場所に待ち受けていたのは、邂逅と新たな試練で!?

ごちそうを食べて自分の部屋で寝たはず…だが目覚めると、ナツは荒れ狂う海の上にいた。どうして自分がここにいるのかわからない。やがて流れ着いた無人島。生きるための過酷な冒険が始まった!! 冷凍保存によって、人類滅亡を回避するため発動した7SEEDS（セブンシーズ）計画。地獄のように変わってしまった地球で、今を生きることを余儀なくされた若者たち。彼等は生存者を探す旅の途中で、巨大シェルターの存在を知る。そこに残された日記を読む中、地下での生活の全容が明らかになっていくのだが!?

ごちそうを食べて自分の部屋で寝たはず…だが目覚めると、ナツは荒れ狂う海の上にいた。どうして自分がここにいるのかわからない。やがて流れ着いた無人島。生きるための過酷な冒険が始まった!! 人類滅亡の危機を回避するため、発動された7SEEDS（セブンシーズ）計画。未来に行くため子供達は一か所に集められ、英才教育を施されていた。17歳になった彼等を待っていた最終試験は「7人になるまで生き残ること」。過酷な環境下で、次々と淘汰（とうた）されていく候補者達。果たして誰が未来に行けるのか――!?

「7SEEDS」──那是日本政府為了要從隕石撞擊的災難中，預防人類滅亡而秘密進行的留種計畫。為了活存下去而接受特殊訓練的夏組－A，以及放牛班夏組－B的人，現在終於會合了，會合之後將產生對立呢？還是會共同奮鬥？亦或者是…？真正的試煉即將開始了──！

为了脱离陨石撞地球这个人类史上最险恶的危机， 政府策划了一个「7SEEDS」计划。 夏组-B被夏组-A所设下的陷阱所玩弄， 只为了测出其他人个别的能力。 后来他们几个发现了一艘神秘的大船，于是决定上去探索。 知道船的真实身份之后，在一波波不安与恐怖当中， 他们每一个人所选择的路是……？