執行【人類總體改造計畫】的ＤＲＦ【技術文化遺產復興財團】，從火星帶回來的【Ｎ５Ｓ病毒】所引起的〈怪物禍害〉擴散到整個地表。地表上，到處充斥著死了之後依然蠢蠢欲動的Ｎ５Ｓ病毒感染者…。 東亞重工的人造人庚　造一跟ＡＩ冬順利救出囚禁在【第三ＭＳＣＦ】伊恩．葛琳。 另一方面，ＤＲＦ總部的總主尼爾迪跟下層組織公眾衛生局的奈連將軍想法產生衝突，雙方對立越加白熱化。在混亂之中，總主尼爾迪癱瘓了奈連的力量後繼續推動計畫，把列夫博士在火星上所發現的逆相寫像重合體朝地表散播。重合體將怪物當成媒介，以爆炸性的速度不斷增殖，將地球上所有東西都條碼化，到最後胚珠會實現宿主的願望。 條件就是，讓帶原者的身體所出現的花粉跟重合體進行受精…伊恩再次面臨危機!!

ＤＲＦ【技術文化遺產復興財團】從火星帶回來的【Ｎ５Ｓ病毒】所引起的〈怪物禍害〉擴散到整個地表。地表上，到處充斥著死了之後依然蠢蠢欲動的Ｎ５Ｓ病毒感染者…。 東亞重工的人造人庚 造一查出該計畫－－ＤＲＦ所執行的【人類總體改造計畫】－－的重點Ｎ５Ｓ病毒帶原者，伊恩．葛琳被囚禁的地方。他拒絕了同伴的制止，單槍匹馬潛入ＤＲＦ的下層組織公眾衛生局的根據地，【第三ＭＳＣＦ】。 但是ＤＲＦ總部比造一早一步攻擊了第三ＭＳＣＦ，開始壓制從公眾衛生局的將軍奈連以下的所有組織。對方使用了曾攻擊過跟造一同為情報員的壬　二銖的危險液體【逆相寫像重合體】，還朝著襲來，而親自指揮該行動的正是ＤＲＦ的總主尼爾迪本人！！ ＤＲＦ內部突然產生分裂。奈連、尼爾迪因為各自的想法使得戰局更加混沌不明。如今造一救回了伊恩，他能夠找出扭轉目前狀況的方法嗎！