从现代大学制度的全面构建与恒定性来说，其不足也是明显的。“兼容并包、思想自由”虽然被公认为经典性的现代大学指导思想，影响不绝，但并未能在制度上得以确立，并进而在现代中国的范围内发生并形成作用。当然这与其时的历史语境有关，一则近代以来的中国军阀混战连绵，北洋政府自不必提，就是南京国民政府成立后，不是忙于内战，就是为日本侵略所困，难得有时间集中整顿教育，也少有精英实权人物能意识到发展教育关系国本之重要；二则控中国国家政权薄弱，对大学很难具有绝对的调控能力，大学办学的自主性还是相当之高的。以上两点与日本明治维新中央集权，且以国家强力推行德国经验以求发展教育，振兴国本之思路自然大不相同。