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R语言与Bioconductor生物信息学应用
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计算分子进化
《复旦大学进化生物学丛书·计算分子进化》包含核苷酸置换和氨基酸置换模型、系统发育重建的常规方法及最大似然法与贝斯推断法、分子钟检验与物种分歧时间估计、适应性进化检测以及分子进化模拟技术等章节,分子进化生物学是一门利用分子数据重建物种或基因间的进化关系并了解其进化过程与机制的学科,统计模型及算法则是分子进化研究中的主要方法论工具。 -
生长和形态
为什么生命和物理现象如此千姿百态?达西·汤普森的这本经典著作关注的正是事物生长的道路和采取的形态。首版于1917年的这本著作具有重大的历史意义,它从数学和物理学层面分析生命的进程,因为富有诗意的描述而著称。作为一个敏感地关注自然界的魅力和美的伟大的科学家,他讲述了跳蚤和履螺;嫩芽和种籽;蜂巢和雨点;陶工的拇指和蜘蛛的网;肥皂膜和油泡;小卵石在池水中的飞溅。达西·汤普森的著述,被誉为“既是优美的文学又是高深的科学;既是科学论文,又是娓娓道来的散文”,现在可以呈献给更广泛的读者,由当今最伟大的科普工作者作序,解释了本书对于新一代读者的重要价值。 -
自达尔文以来
《自达尔文以来》主要内容:在过去的时间里,科学之手对于人类朴实的自恋有过两次重大的打击。第一次是认识到我们的地球并不是宇宙的中心,而是大得难以想象的宇宙体系中的尘埃……第二次是生物学的研究剥夺了人类特创的特殊优越性,将人类废黜为动物的后裔。若干年后,对于人类自恋的第三次重大打击又将是什么呢?亿万年的地球巨变,毫微间的存亡一瞬,都因古尔德的生花妙笔跃然纸上。 点击链接进入英文版: Ever Since Darwin: Reflections on Natural History -
消失的微生物
为什么现在的孩子越来越高、越来越胖?为什么青少年糖尿病越来越多、发病年龄越来越小?为什么越来越多的现代人患上了哮喘、过敏性鼻炎以及五花八门的食物过敏?种种“现代疾病”背后是否有一个共同的“罪魁祸首”? 美国著名科学家马丁·布莱泽申论,在过去的几十年里,由于滥用抗生素及剖宫产,我们在不经意间已经伤害了与人类协同演化了数十万年之久的“微生物朋友”,特别是在我们的孩子们身上。这扰乱了人体内微生物的稳态,打破了人体与微生物之间的平衡,进而危害了我们孩子的代谢、免疫和认知能力。 恩格斯的告诫犹在耳畔:“我们不要过分陶醉于对自然界的每一次胜利,对于每一次这样胜利,大自然都报复了我们。”在《寂静的春天》里,蕾切尔·卡森提醒我们,滥用滴滴涕等杀虫剂会危害地球上其它的生物;在《消失的微生物》里,马丁·布莱泽提醒我们,滥用抗生素及剖宫产会危害我们自己的后代。 作为人类微生物群系研究的先驱之一,马丁·布莱泽在本书中既从科学的角度梳理了上述问题的来龙去脉,又从个人及社会的层面探讨了可行的解决方案。广大的中国读者,特别是生物科研工作者、医疗卫生从业者、政府机构决策者或可从中有所借鉴。 -
生命的多样性
英美国家畅销科普图书,作者两次荣获美国普利策奖。 威尔逊教授所描述的生命多样性其科学可信之处在哪?生命多样性的范围有多大?是什么使这种多样化逐渐减弱?为什么这种减弱趋势如此重要?威尔逊教授用生动的、非教科书式的、诗一般的语言回答了上述所有问题,充满了独创力和迷人的洞察力。 在《生命的多样性》中,威尔逊以大量的事例论证了,生物多样性在人类追求短期利益的驱动下,正在频频告急。他大声疾呼,生物多样性是我们最宝贵但又最不被人认知的财富,一旦出现物种灭绝,人类将遭受难以估量的损失。除了诉诸人类对自身利益的理性“盘算”外,威尔逊同时诉诸人类的感情和道德。“人们更乐于聚集在国家公园去赏自然景色,登高远眺奇峰异石和高山流水,以及自由自在的动物。也许并不需要什么理由,他们远道而来,沿着海岸漫步,就这样尽可能地贴近大自然。”威尔逊把人类的这种潜意识命名为“亲生命性”。人性复杂难言,如果说“急功近利”的人性有可能使人类遭遇灭顶之灾,那么“亲生命性”的人性则可能使人类免于堕落万劫不复的深渊。