《少年魔笛手》的主要内容是：一只脾气古怪但心地善良的神奇的猫，不仅会说话，而且具有超常的思维，在与他的伙伴——一个看上去一脸傻相的少年魔笛手以及生活在他鼻子底下的十来只非同寻常的老鼠，一起四处流浪的日子里，来到了糟糕的布林兹城——这里正在闹鼠疫……后来，他们结识了市长的女儿——一个满脑子奇思妙想的小女孩。一只猫，一群老鼠，一个男孩，一个女孩，意想不到的有趣故事就这样开始了。