《历史》，又名《希腊波斯战争史》，大约写于希罗多德住在萨摩司的一段时期，生前没有完稿，后来亚历山大里亚的注释家将全书加以整理，分为九卷，每卷都冠以一位文艺女神之名。这种格局和分卷方法沿用至今。这部著作以希波战争为主线，广泛地记述了当时的历史状况。整篇内容大致可分为两个部分。第一部分由第一卷到第五卷，可以看作战争的背景介绍，它以希腊人和异族人之间的相互关系和希罗多德认为的纠纷的起因，以及波斯的兴起为主要线索，叙述吕底亚、米底、巴比伦、埃及、波斯、斯基泰、利比亚和希腊等地区的历史往事、地理、民族和风俗习惯。第二部分从第五卷第二十九章起到第九卷末尾，可以看作战争的描述，它以希波战争为主，从爱奥尼亚起义，一直写到普拉提耶和米卡尔战役，讲述了希波战争的主要过程。整部著作内容博杂，脉络分明，重点突出，结构完整。希波战争无疑是《历史》叙述的重点，但希罗多德又不仅仅局限于这次战争，它以相当大的篇幅记录了希腊及相关国家的历史传说、风土民情和逸闻趣事，对各种各样的政治制度和风俗习惯作了大量收集，认真地整理并加以比较、分析、研究。这在一定程度上还表现出一种崇尚东方智慧和东方文化的心态，与此同时本书中还大量地记录了一些神谶、灾异、梦兆等神秘现象。这些内容扩大了本书的记录，拓宽了本书的视野，使其完全超越一部战争史的范围，而成为当时西亚、北非以及希腊各个城邦的一部“通志”。与其说它是一部战争史，不如说它是一部希腊人记录当时希腊人所知世界的世界历史。 《历史》一书反映出来的历史观比较复杂，一方面他对历史过程持有一种宿命观点，人们的祸福和国家的繁荣都受到命运之神的左右。他认为，神有嫉妒之心，因此树高要遭雷击，名大会引神忌，而且“当城邦或民族将要遭到巨大灾祸的时候，上天总是会垂示征兆的”，历史事变和天意之间有一种神秘的联系。但在战争的叙述中，他又认为胜负受到交战双方主客观条件的制约，并非完全天定。他还试图以历史自身去说明历史，这在希腊历史思想发展史上具有十分深远的意义。由于这样的原因，希罗多德在历史叙述中表现出一种难能可贵的客观立场，而这一点正是历史成为一门科学的基础。他奠定的一些原则，对西方历史学的发展起了巨大的推动作用，直到今天，对我们当代的历史研究还具有重要的现实意义。