《孔子的故事》分为三部分： 第一部分是<细说孔子>。细致地介绍了孔子一生的事迹和为人、为学、为政的学说，而且还比较详细地介绍了孔子之前的人类社会，春秋时期的时代现状，孔子的弟子以及在孔子之后的主要思想家。黎东方先生在此部分把孔子定位在“集大成者”和“百世师”的地位。 第二部分<孔子传略>。这部分对孔子的生平、学说和弟子做了简要的叙述。包括孔子早年的生活，创办了我国第一所私立学校，从政的痛心经历，有目的地漫游，孔子的晚年生活及其弟子的情况。 第三部分是附录部分，收录了黎东方先生的四篇著作——《我对历史的看法》《中国历史的大特点》《中国历史上的民族传统》《中国文化之历史的分析》。在这四篇著作中黎东方先生对历史做了个人的总括性的看法，也对孔子在历史上的地位做了分析。