卷一 南海新光 玄理参同 韦陀教神坛与大乘菩萨道概观 唯识二十论钩沉 关于毗沙门天王等事 老子臆解 周易西行 超人论衍 专史·新研·极成 陆王学述 梵文研究在欧西 神名释 卷二 小学菁华 卷三 孔学古微 周子通书 肇论 唯识菁华 易大传——新儒家入门 卷四 序跋 文论 文事 诗论与诗存 卷五 朝霞 快乐的智识 卷六 苏鲁支语录 尼采自传 宗教牛活 启蒙艺术家与文学者的灵魂 卷七 佛教述略 行云使者 社会进化论 神母道论 安慧<三十唯识>疏注释 周天集 周天集(续集) 因明蠡勺论 卷八 薄伽梵歌 薄伽梵歌论 卷九 母亲的话(一辑——二辑) 卷十 母亲的话(三辑——四辑) 卷十一 瑜伽的基础 瑜伽论(一—三) 卷十二 瑜伽论(四) 瑜伽书札集 卷十三 神圣人生论(第一卷，第二卷第一部) 卷十四 神圣人生论(第二卷第二部) 卷十五 奥义书(一——十五) 卷十六 奥义书(十六——五十) 附：室利阿罗频多《由谁奥义书》、《伊莎奥义书》疏释